NGS et ARN

[elestaunord]

Coucouuuuuu

Désolée de vous déranger encore une fois j'ai une petite question...

J'ai fait un DM et cet item était compté juste : "on peut séquencer de l’ARN en NGS"

Mais je comprends pas pourquoi car pendant la PCR clonale du NGS on utilise la TAQ polymérase qui travaille que sur l'ADN. Il faut que nous transformons l'ARN en ADN via la reverse transcriptase non?

Merci d'avance pour votre réponse et bonne soiréee

[Stabilo'drey]

Helloooooo !

Alors je viens d'aller vérifier les diapos, pour Illumina on précise bien qu'on utilise la TAQ polymérase, pour ThermoFisher on ne le précise pas mais je suis aller regarder sur leur site, et ils parlent de la TAQ polymérase à plusieurs reprise donc j'en conclu qu'ils l'utilisent eux aussi.

Pour le coup la prof a vraiment énoncer à plusieurs reprise qu'il est IMPOSSIBLE de faire une PCR sur un brin d'ARN car la Taq polymérase ne bosse que sur de l'ARNm.
Donc tu as entièrement raison, à partir des infos qu'on a dans le cours, on ne peut pas séquencer de l'ARN en NGS, a moins de passer par une étape de reverse transcriptase afin de créer un brin d'ADNc.

Pour ta culture personnelle, en aller un peu regarder le site de Illumina j'ai l'impression qu'il existe des techniques où l'on peut séquencer l'ARN autre qu'en passant par la transcriptase inverse, mais je t'avoue que je me suis pas renseignée plus que ça, et c'est pas savoir.

Dans le cours on a aucun moyen de dire que la NGS est capable de séquencer de l'ARN, sinon la prof l'aurai dit tout simplement. Donc retiens que 'était une errata dans le DM et que la réponse est fausse.

Voila ! J'espère que ça a pu t'aider

[elestaunord]

Ok trop cool merci beaucoup pour ta super réponse hyper complète
Merciiiii !!!

Bonne soirée