coude béta new version?

[Spooky]

Oyé oyé

Dans la diapo 72 il dit qu'il y a souvent une glycine en position 3 du coude.
Mais normalement les AA du coude (exceptée la proline) ne doivent pas être polaires?

Merci pour une réponse

[Le Chat]

La science évolue....

[LAMsa]

Je suis certaine que c'est faux, ça ! En dehors de la proline, TOUT est polarisé. Attendons confirmation

[thomas086]

Salut !

Alors je n'ai pas encore eu accès aux diapos mais si c'est le cas ça me semble bizarre et nous lui feront remonter

[Spooky]

Oky merci on attend

[LAMsa]

Coucou !

Je te mets la diapo, Thomas :

[Blax]

Yo

Je me suis posé la question l'année dernière et je ne trouve pas ça illogique et même, je trouve que ça convient mieux que l'idée que dans le coude béta, tous les acides aminés (sauf la proline) sont polaires! Je pense que le prof précise ici une notion qu'il n'a pas évoquée l'année dernière.

Pourquoi?
Parce que l'intérêt d'avoir des AA polaires est la formation de liaisons hydrogènes pour stabiliser le repliement du coude. Or, le repliement à 90° est déjà assuré par l'hétérocycle en covalence avec l'AA 1.
La liaison hydrogène n'est nécessaire qu'entre cet AA 1 et l'AA 4 (donc AA 1 et AA 4 ont besoin d'être polaires) pour renforcer encore plus la stabilité du coude. A contrario, AA 3 (glycine souvent) n'a pas besoin d'une telle polarité puisqu'il n'est pas engagé dans une liaison hydrogène = on peut donc piocher un AA apolaire! Imaginez même qu'on prenne un AA polaire en position 3, cela changerait la relation entre les AA du coude; on pourrait avoir un pont hydrogène entre AA 3 <--> AA1 ou AA 3 <--> AA 4; ce qui serait déstabilisant.
L'intérêt de la glycine est qu'elle est petite (R = hydrogène) et en même temps confère une certaine flexibilité de la structure => permet ainsi un plus petit encombrement stérique = structure plus stable;

La présence de la Glycine en position 3 est justifiée.
J'espère que ça vous avance Bon courage

[Spooky]

Ok merci Blax pour ces précisions, et ca parait logique^^
Je laisse en attente en attendant une réponse définitive du prof ou c'est ok?

[Blax]

Retiens ça pour l'instant. Pour être certain de ce qu'il faut retenir au CC, on posera la question au professeur dans un prochain mail
Bon courage

[Spooky]

Ok thanks

[LAMsa]

Coucou !

S'il vous plait, concernant le coude béta, avons nous réellement besoin que les AA 1 et 4 soient polaires ? Je vous renvoie à cette diapo :

On voit que la liaison se fait entre le carbonyle de la liaison amide et l'amine de la liaison amide de l'autre côté. De plus, il n'est pas précisé dans la diapo que els AA sont polaires !

MERCI

[Blax]

Salut

Il faut quand même que tu fasses ta liaison hydrogène (qui est une spécificité des AA polaires) donc ce caractère là est à préserver oui
Si non polaire => pas de différence d'électronégativité => pas de liaisons hydrogènes possibles ...
Personnellement, je pense que si un seul des deux AA est polaire, ca peut suffire; après on est pas en chimie orga ^^ Si le prof ne met pas clairement Polaire dans sa diapo, c'est que ce n'est pas à retenir Mais je comprends que ça aide à mieux cerner les choses

Bon courage