Réponses des professeurs années précédentes:
2013-2014: viewtopic.php?f=474&t=37276
2012-2013: viewtopic.php?f=322&t=36035
Bonjour,
Concernant le cours de Génétique de l'UE11, il n'y a pas de changements prévus par rapport à l'année dernière que ce soit pour ceux du Pr. Paquis ou moi même
Cordialement
Sylvie Bannwarth
11.05.2015:
Allez voir ce post, il y'a des réponses qui peuvent vous intéresser viewtopic.php?f=605&t=69278
28.04.2015::
viewtopic.php?f=605&t=68473 Pour plus de clarté, je remets les 2 questions de ce même post ici :
QCM de 2013 : dans le cadre d'une suspicion de patho monogénique, vous souhaiter rechercher la/les mutation(s) causale(s) dans le gène responsable. Concernant les techniques que vous vous pouvez être amenés à utiliser :
A)Extraction d'ADN
B) Western Blot
C) PCR-RFLP
D) PCR-Séquençage
E) A,B,C,D fausses
NEWS 11.05.2015 :
J'ai reposé la question parce que beaucoup d'entre vous ne comprenaient pourquoi la réponse était seulement D et pas AD. Et en fait la réponse de ce qcm est bien AD !
Voici la nouvelle réponse du professeur à ce sujet :
DESOLEE JE VOUS AI REPONDU SUR LE CHOIX ENTRE PCR-RFLP ET PCR-SEQUENCAGE MAIS EFFECTIVEMENT TOUTES LES BONNES REPONSES CONCERNANT CE QCM SONT A ET D. EN EFFET IL FAUT FORCEMENT UNE EXTRACTION D'ADN GENOMIQUE POUR POUVOIR REALISER LA PCR-SEQ
DESOLEE POUR LA CONFUSION !!!!!
Bonjour
La réponse est uniquement la D PCR-Séquençage (= justification pour la comparaison entre la PCR-RFLP et la PCR-séquençage)
car dans ce cas on ne demande pas à identifier une mutation en particulier mais on cherche à étudier le gène responsable.
Pour la réponse C la question aurait été du genre: vous recherche la mutation c.333A>G dans le gène ABC. Dans ce cas on cherche une mutation ciblèe
Dans la question posée en 2013 on se référait à l'exemple du synd. de Wolfram dans le schéma du cours.
Bon courage
Cordialement
Sylvie Bannwarth
13.04.2015: Aller voir ce post, ca peut vous intéresser
viewtopic.php?f=605&t=67284&p=381539#p381539
13.04.2015: Ce post aussi peut vous intéresser
viewtopic.php?f=605&t=66879&p=381583#p381583
27.04.2015: réponse à un qcm de 2013, allez jeter un oeil !!
viewtopic.php?f=605&t=68473
Dans le cas de l'Achondroplasie, nous connaissons la mutation responsable de la maladie sur le gène FGRF3.
Pour établir le diagnostic de cette maladie, nous allons réaliser une PCR-RFLP, car nous avons les enzymes de restriction spécifiques pour cette mutation.
La PCR-RFLP, est ensuite suivie d'une PCR-séquençage, afin de vérifier officiellement la séquence nucléotidique de la séquence génique mutée.
Voici la question:
Pour toutes les maladies dont les mutations sont connues, et dont le diagnostic se fait grâce à la PCR-RFLP (dans le cas où des enzymes de restriction spéciales existent), est-il obligatoire de réaliser une PCR-séquençage de vérification à chaque fois?
ou ce cas n'est-il retrouvé que dans le cadre de l'achondroplasie car c'est une maladie grave et qu'il est important de réaliser un diagnostic certain?
Bonsoir,
En diagnostic, quelque soit la mutation mise en évidence on doit toujours confirmer sa présence par une 2ème expérience. Idélaement, il faut un nouveau prélèvement pour refaire l'extraction d'ADN et la recherche de la mutation. A défaut d'avoir un nouveau prélèvement on refait une extraction d'ADN génomique et si possible on confirme avec une autre technique. Dans l'exemple de l'achondroplasie, on confirme la manip de PCR-RFLP par une manip de PCR-séquençage.
Dans le cas où le diagnostic est fait en PCR-séquençage on refait une manip de PCR-séquençage mais avec d'autres primers.
Ce qu'il faut retenir c'est que la présence de la mutation (quelque soit la pathologie) doit toujours être confirmée par une seconde expérience.
Bonne révision
Cordialement
Sylvie Bannwarth
NEW 18/05/15
La question :
On avait fait un QCM avec dans l'énoncé "concernant le clonage moléculaire" et un des items parlait des vecteur d'expression. Certains ont compté ce dernier faux car ils distinguaient clonage moléculaire en opposition à clonage d'expression. Voici la réponse que j'ai apporté la confirmez-vous ?
"Le clonage d'expression est une catégorie du clonage moléculaire ! C'est pas faux de dire clonage moléculaire d'expression par exemple.
En revanche, là où la distinction doit être faite c'est entre vecteur de clonage et vecteur d'expression.
Ces 2 types de vecteurs ont 2 fonctions bien différentes et ne s'englobe pas l'un dans l'autre.
Le vecteur de clonage sert à isoler physiquement un fragment d’ADN d’intérêt et à amplifier le nombre de copies de cet ADN ( le cloner ++)
Les vecteurs d’expression servent à transférer un gène dans une cellule hôte eucaryote pour le lui faire exprimer et suivre sa fonctionnalité, la localisation, sa possible séquestration ect"
Voici le qcm en question :
"QCM 5 : A propos du clonage moléculaire :
A) Les vecteurs de clonage sont destinés à isoler physiquement un fragment d’ADN d’intérêt et à amplifier le nombre de copies de cet ADN
B) Les vecteurs d’expression sont destinés à transférer un gène dans une cellule hôte eucaryote
C) Une étape de déphosphorylation est nécessaire avant la ligation de fragments d’ADN clivés par des d’enzymes de restriction qui génèrent des extrémités cohésifs
D) L’enzyme nucléase S1 possède une activité 5’-3’polymérase
E) Aucune de ces réponses n’est correcte"
Sa réponse :
Votre réponse est tout à fait exacte mais je nuancerai votre phrase suivante:
"Ces 2 types de vecteurs ont 2 fonctions bien différentes et ne s'englobe pas
l'un dans l'autre."
Ce n'est pas si simple puisqu'en effet le vecteur d'expression comprend les même caractéristiques
que les vecteurs de clonage cad une origine de réplication+un gène de resistance à un antibiotique (procaryote) + un site multiple de clonage. Mais il a en plus de quoi fonctionner dans une cellule eucaryote (gène de selection / promoteur/origine de replication eucaryote) Autrement dit on peut utiliser un vecteur d'expression comme vecteur de clonage (les fonctions pour les eucaryotes ne seront pas utiles mais cela permettra tout de meme d'isoler et d'amplifier des molécules d'ADN) Par contre le vecteur de clonage ne peut pas servir de vecteur d'expression car il n'a pas ce qu'il faut pour fonctionner chez les eucaryotes.
Votre QCM est très bien !!!!
Bon courage a tous
La question :
1)Concernant ce QCM de 2011 :
Pour réaliser une protéine de fusion, avec une étiquette (Tag) en NH2-Terminal, à partir d’un ADN complémentaire codant pour la protéine X, donnez les vraies,
A) l’ADN complémentaire codant pour la protéine X doit posséder son propre ATG et son propre codon stop
B) l’ADN complémentaire codant pour la protéine X ne doit pas posséder son propre ATG mais doit posséder son propre codon stop
C) l’ADN complémentaire codant pour la protéine X doit être inséré en 5T de l’étiquette
D) l’ADN complémentaire codant pour la protéine doit être inséré en 3’ de l’étiquette
E) la traduction débutera à l’ATG de l’étiquette et se terminera au codon stop de l’ADN complémentaire codant pour la protéine X
Ce qui pose problème à certains étudiants c'est la notion d'ADNc = simple brin. Car cette protéine fusion va être incorporé à un vecteur d'expression = ADN circulaire double brin. Pourquoi parle t-on d'ADNc ?
Sa réponse :
QCM de 2011 :
"On parle d'ADNc au moment d'un clonage pour toujours savoir de quoi on part si c'est du gène ou de l'ARNm. Effectivement un ADNc est simple brin mais comme il s'agit d'une question sur la stratégie sur le clonage et la position des étiquettes cela sous-entend que l'ADNc sera rendu double brin avant sa ligation dans le vecteur. Ceci ne modifie pas la réponse quant à la stratégie à adopter sur présence ou non de l'ATG ou du Stop et de la position de l'étiquette en 3'ou 5' de l'insert. Les bonnes réponses sont B, D et E"
En gros ne vous prenez pas la tête, soyez logique et pertinant