Sonde Taq man

[Crashtest]

Holà !

J'aurai voulu avoir une petite confirmation concernant la sonde Taq Man:

Taq Man : c'est un primer qui va s'hybrider au milieu à étudier (le brin complémentaire)

• on a 2 fluorochromes séparés par des nucléotides
• élongation par la Taq polymérase dans le sens 5' -> 3'
• dégradation des nucléotides par une exonucléase dans le sens 5' -> 3' (Taq Polymérase)
• les fluorochromes vont s'éloigner, donc ils ne vont plus s'inhiber
• fluorescence

Donc si la distance est courte, le quencher peut inhiber la fluorescence du rapporteur

Merci d'avance

[Chob]

Salut !

Oui voilà c'est ça, sauf que le sonde Taqman s'hybride au brin parent et non au brin complémentaire !

Du coup quand la Taq polymérase va vouloir allonger le brin complémentaire, elle va être bloquée par le sonde, et c'est pour ça que la polymérase va devoir "casser" la sonde pour passer, pour continuer l'élongation du brin complémentaire.

Et c'est en la "cassant" que les 2 fluorochromes vont s'éloigner, et on va avoir de la fluorescence !

[Crashtest]

Merci, je comprends mieux du coup

Bonne journée !