Étapes de la chimie thérapeutique

[elise05]

Salut !

Après le tut de ce matin je me suis rendue compte que j'avais pas très bien compris les différentes étapes de découverte de la molécule active...

Donc d'abord on va découvrir la cible etc (ça j'ai compris),
puis c'est là que j'ai besoin qu'on m'éclaire 😅

1. Découverte de la molécule active
-> le hasard, les ≠ types de criblage, les me too, l'ethnopharmacologie, puis à partir du ligand

ensuite on a (d'après le titre de la fiche) 2. l'établissement de la structure chimique d'un composé, mais à cet endroit on parle de la conception assistée par ordinateur (donc du “test” des ligands sur les cibles) mais je comprends pas pourquoi on considère à ce moment qu'on établit la structure chimique d'un composé puisqu'en soi on doit déjà connaître sa structure pour faire la CAO non?

Puis on a la RMN, qui grâce au spectre nous permet d'identifier les groupements (donc là ça colle avec l'établissement de la structure)

Puis on nous parle de l'isolement de la molécule

Et ensuite on nous reparle de l'établissement de la structure d'un composé 😭😭

BREF (jsuis dsl pour ce post long et confus mais c'est l'état de mon cerveau là)
du coup je me demandais si y'avait pas un peu un mélange dans l'ordre des étapes ? 😅
Puisque dans la logique des choses ce serait pas (c'est mon hypothèse svp corrigez-moi mdr) :
découverte de la molécule -> isolement (enfin jsp mais si on va étudier une molécule vaut mieux l'avoir seule nan?) -> établissement de la structure du composé
-> conception assistée par ordi (pour enfin tester avec la cible)

C'est peut-être hyper faux mais voilà, je comprends par pourquoi on parle d'abord de la CAO (qui nécessite de connaitre la structure) puis qu'on nous parle après de déterminer la structure... pour ensuite isoler la molécule (qui nous intéresse depuis le début) en dernier 😅😅

[Lucastra-zeneca]

Salut !

"mais je comprends pas pourquoi on considère à ce moment qu'on établit la structure chimique d'un composé puisqu'en soi on doit déjà connaître sa structure pour faire la CAO non?"
on doit pas forcément connaître sa structure, seulement des données (tridimensionnelles) qui vont permettre de trouver la cible

Ta chronologie est juste, mais la CAO est l'établissement de la structure, mais on isole bien la molécule avant quand même ahah !

J'espère que c'est plus clair ?

[Camnésie]

Hey !!

Je me permets de relancer car j'ai l'impression qu'il y a une petite incohérence avec les ronéos et ta fiche. En fait, je travaillais sur les ronéos de l'année dernière et le plan était découpé de telle sorte que :
- conception RMN
- conception assistée par ordinateur
Faisaient parties de la catégorie "sources" .

Du coup je le voyais en mode :
- conception assistée par ordi: on trouve la petite molécule en testant par ordi les interactions avec la cible pour ensuite synthétiser cette molécule testée dans notre cible.
- conception RMN : à partir de la conception RMN on "construit" une molécule à partir de plusieurs épitopes qu'on raccorde pour former une nouvelle molécule active (donc à partir de rien de déjà existant à part des molécules de base), donc c'est "source de création" de molécule active.

De plus dans la ronéo, suivant son plan :
l'établissement de la structure composé repose seulement sur : cristallographie, spectro RMN, spectro de masse et synthèse totale.

Pourtant j'étais allée checker les erratas de l'année dernière et aucune erreur de structuration du plan n'était rapportée, du coup j'en ai conclu que cela suivait ce qu'avait dit le prof "à la lettre".

Mais en faisant le tut de ce matin, et en voyant la correction j'ai pu constater que les deux types de conception présentées au dessus tu les classais non pas comme une source de conception/ fabrication, mais comme de conception = établissement de la structure du composé.

Mais du coup je suis totalement perdue , je ne comprends pas comment établir la structure d'un composé (ex: t'as ta molécule ligand issue de ta source, tu veux déterminer sa structure, donc normalement tu fais par exemple ta cristallographie et boom, mais comment avec RMN (en utilisant des épitopes qui vont dans le site actif de la CIBLE), on étudie la structure du ligand découvert ?)

Breffff, omg message si long je suis désolée, mais je suis vraiment, complétement embrouillée dans toutes ces notions, j'ai l'impression de tout avoir compris de travers...

Help please

[Lucastra-zeneca]

Je mets le post en attente, j'irais poser la question à la prof.

Des tuteurs d'il y a 2ans sont d'accord avec moi, mais l'année dernière non.

Je pose la question, et je vous redis tout ça !

[Camnésie]

D'accord merci beaucouppp

[elise05]

ok c'est + clair merci ! et merci d'aller poser la question !

[Lucastra-zeneca]

Salut à tous !

J'ai donc posé la question à la prof, puis elle a sorti les cours sur moodle ( allez check, mais don't worry RIEN n'a changé)

Bref, quand j'ai vu la prof je lui ai demandé, elle était d'accord avec moi, mais à préciser, je cite "vous les tuteurs vous vous prenez trop la tête, vous cherchez trop loin". (super)
Ce qu'elle veut dire, c'est que j'ai raison dans le sens qu'on ne découvre pas la cible à proprement parlé, mais elle simplifie le fait que ça fait partie d'une découverte.

Alors pour faire simple : la CAO + conception par RMN --> découverte de la molécule active (en p1) bah oui en L2 pharma on voit pas ça comme ça jpp les discordances.

mais elle a rajouté qu'elle ne posera pas de questions aussi ambigu

donc bon, sorry pour le stress accorder, on avait chacun notre part de raison, mais l'essentiel c'est que maintenant vous soyez prêt pour tout.

des bisous

[Camnésie]

Alors tout d'abord merci beaucoupp !
Mais du coup je ne suis pas sure de bien avoir compris, la CAO et conception RMN sont-ils des sources de découverte de la molécule active ? Ou permettent ils l'établissement de la structure (car de ce que je me rappelle source + établissement de la structure de la molécule active font partis de la même "branche" : découverte de la molécule active, qui sera d'ailleurs suivie par la phase d'optimisation)

Merci

[Lucastra-zeneca]

du coup elle considere sources de découverte ! mais on peut les mettre en établissement de structure (mais pour elle retenez seulement la découverte)
elle simplifie vraiment au max pour pas que vous vous trompez

et ensuite on a bel et bien phase d'optimisation

[Camnésie]

D'accord mercii, donc pas de piège dans les sous-parties si je comprends bien ?
(désolé je pose trop de question mdr mais c'est vraiment pour être sûre)

[elise05]

Ok super merci d'avoir demandé ! (pcq oui en voyant son diapo j'ai re-beugué mdr) mais c'est vrai qu'au final je trouve ça plus logique de considérer que c'est à la fois une source de découverte (par hasard par ex) mais aussi d'établissement de structure puisqu'on utilise des techniques précisant la structure...
bref je retiens ce que la prof a dit merci beaucoup!

[Lucastra-zeneca]

Alors Camille, je peux pas t'assurer à 100% que ça tombera pas.
Mais je sais que c'est carrément pas son style de qcm, donc ça m'étonnerait vraiment...

mais voilà bon courage à toussssss

[Camnésie]

D'accord merci beaucoup !!