RIP/Rc

[sarad1506]

Hello

Dans la fiche tut en bas de la p9 on nous dit : RIP = Q fragment PCR / Q ADN réaction et Rc = Q fragment PCR / Q ADN réaction). Donc RIP et Rc ont la même formule? c’est bizarre parce que du coup pour savoir si on a un enrichissement on doit comparer les 2... peut être que j’ai mal compris la formule .. je sais pas helppp

[El Sangliero]

Salut Sarad1506 !
Alors non ce n'est pas une erreur, même si ce n'est pas très claire je l'avoue (oupsi) mais en fait on aura d'une part :
RIP = Q fragment PCR / Q ADN réaction
avec une réaction effectuée avec l'immunoprécipitat
d'autre part on a :
Rc = Q fragment PCR / Q ADN réaction
avec une réaction effectuée avec l'input, donc l'ADN de départ
finalement on pourrait dire que :
RIP = Q fragment PCR / Q ADN immunoprécipitat
Rc = Q fragment PCR / Q ADN de départ

En fait dans le cas du RIP, on va vouloir voir quelle est la proportion d'une certaine partie de l'ADN par rapport à toutes les séquences qu'on a récupéré avec l'immunoprécipitation donc toutes les séquences portant la modification post-trad que l'on étudie (par exemple, Q de gène X (reconnu et multiplié par PCR)/ Q de tout l'ADN portant un résidu acétyl sur une histone)
Et dans le cas du Rc, on va vouloir voir quelle est la proportion d'une certaine partie de l'ADN par rapport à toutes les séquences qu'on a dans tout l'ADN que l'on étudie (par exemple, Q de gène X (reconnu et multiplié par PCR)/ Q de tout l'ADN )

Donc si RIP>>>Rc, ca signifie que l'on a bien un enrichissement de l'ADN par la modification recherchée

J'espère que c'est plus clair pour toi, sinon dis-le moi !
Bisous biocellois
PS : j'espère que les fiches te plaisent