Annatut 2019 NGS

[cinju]

Bonjour, je ne comprends pas l'item A ( parce qu'ils sont fixés en 3 et pas en 5 non ?) et B si vous pouvez m'expliquer mercii d'avance

QCM 5 : Indiquez la ou les proposition(s) exacte(s) :

A) Avec la méthode d’amplification de l’ADN d’un NGS, les brin fils possède une séquence supplémentaire, en effet c’est la séquence complémentaire du primer fixer en 5’ lors de la première hybridation.
B) Cette séquence supplémentaire vas permettre à tous les brins d’ADN de se fixer aux sphères par complémentarité.
C) Accroché à chaque une de nos sphères on a l’amplification issu d’un seul fragment d’ADN, on pourra alors séquencer notre ADN par des puces qui sont calibré pour contenir qu’une seule sphère.
D) Lors du traitement informatique de nos résultats obtenus après un NGS, avoir une profondeur de 100% signifie qu’on a réussi à séquencer 100% de notre région d’intérêt.
E) Les propositions A, B, C, D sont fausses

[AnNévrisme]

Coucou

• Pour l'item A il est faux mais pour une autre raison.

Je vais d'abord essayer d'expliquer ce qu'il t'as posé problème:

En fait il faut faire attention dans l'item quand on parle des :

brins fils qui possèdent une séquence complémentaire

on parle des brins obtenus à la fin -- > c'est juste ils possèdent bien cette séquence supplémentaire en 3'

Par contre

c’est la séquence complémentaire du primer fixé en 5’ lors de la première hybridation

--> ici on fait référence à la première étape dans laquelle en effet la séquence ajoutée est fixée sur l'amorce 5' qui d'hybride à l'extrémité 3' du brin d'ADN d'intérêt.

Par contre là où il y'a une errata c'est que lors de la première hybridation on fixe en 5' non pas la séquence complémentaire aux primers de la sphère mais la séquence de la sphère ! Car dans les étapes d'après on va obtenir le complémentaire de cette séquence et donc le complémentaire des primers de la sphère pour pouvoir avoir appariement

Il faut faire attention aux brins dont on parle et aux ordres des étapes pour ses qcms portant sur le déroulement de la NGS

• Pour l'item B : en effet comme je l'ai aborde juste au dessus on obtiendra à la fin des étapes un brin fils avec en 3' le complémentaire du primers sur les sphères.
Du coup ces bouts complémentaires viendront naturellement s'hybrider sur les sphères et on pourra placer ces sphères avec les brins dans les puits NGS !

C'est ok pour toi ?

[cinju]

D'accord mercii beaucoup! Bonne journée