Site actif de l'enzyme

[LeChatPizza]

Bonjoooooour / bonsoooooouar !

Je me trouve face à un petit dilemme dans le premier cours d'enzymologie (du moins dans la ronéo du premier cours).

Il est dit que les AA de contact composent le site actif, qui a, je cite, "un mircroenvironnement unique, hydrophobe en général". Mais les 9 AA de contacts sont tous des AA polaires. On a donc un site actif qui est globalement hydrophobe MAIS qui est composé d'AA polaires ? Est-ce que c'est dû à la partie qui entoure la cavité ? Pourtant le site actif étant vers l'extérieur, la partie qui le borde devrait être hydrophile...

Voilà... Merci d'avance pour la réponse, ce paradoxe m'intrigue

[Le Chat]

Hey ! Premièrement sache que je suis le seul et unique chat sur ce forum.

Ensuite, je crois me souvenir que l'eau est exclue de part le niveau de compaction hyper élevé de la structure protéique, faisant de ce fait une région hyper dense de laquelle l'eau est exclue, probablement également que l'environnement du SA est hydrophobe. Sinon le terme est mal choisi. En suite pour ce qui est du fait que ce soit bordé d'eau, je crois que ton SA n'est réellement à l'extérieur que quand ton enzyme est activée, dans un état intermédiaire, prête à s'imbriquer avec le substrat.

A la base je venais sur ce psot pour signaler un errata. Page 9 on nous dit que tous les AA (auxiliaires, indifférents, de contact et de conformation) constituent le site actif. Je pense que c'est juste une erreur de formulation de la ronéiste mais bon.

Sur ce le bisous

[LeChatPizza]

Faut pas avoir le monopole de la félinité voyons

D'accord, donc ça dépend de l'état de l'enzyme... Et est-ce que ça pourrait pas être dû au site de reconnaissance ? Puisque le site actif c'est "site de reco + site catalytique", le site catalytique est hydrophile mais le site de reco pourrait faire une espèce de poche hydrophobe autour du site catalytique hydrophile.

Merci en tout cas

[thomas086]

Salut !

Alors en effet tu as raison, quand l'enzyme ne réagit pas avec un substrat le site actif est bien hydophile, mais l'arrivé du substrat va entrîner un changement de conformation qui va exclure l'eau du site actif (sauf si l'eau est un substrat) et à ce moment là, on pourra dir que l'enzyme possède un site actif hydrophobe !

C'est bon pour toi ?

[LeChatPizza]

Oui c'est tout bon, merciiiiiiii

[LAMsa]

Bonsoir !

Excusez-moi, j'aimerais réouvrir ce post.

A la base je venais sur ce psot pour signaler un errata. Page 9 on nous dit que tous les AA (auxiliaires, indifférents, de contact et de conformation) constituent le site actif. Je pense que c'est juste une erreur de formulation de la ronéiste mais bon.

Je suis d'accord avec le châton. N'est-ce pas là un erratum, s'il vous plait ?

Merci.

[thomas086]

Oui, c'est bien un erratum

[LAMsa]

Merci Thomas ! ^-^