Catabolisme des AA : désamination oxydative

[Lisa Morel]

Re coucou ! Pour la réaction catabolisé par la GDH, dans le sens du :

Glutamate => alpha cetoglutarate + NH3 (cofacteur NAD/NADH)

Et dans le sens contraire :

Alpha cétoglutarate + NH3 => glutamate + H2O (cofacteur NADP/NADPH)

Ducoup je me demande si on a aussi H2O + glutamate => alpha cétoglutarate + NH3 ou alors est-ce qu’on a la molécule d’eau en plus dans le sens contraire car on utilise un cofacteur différent à savoir le NADP/NADPH ?

(Ça me paraîtrait plus logique qu’on ait la molécule d’eau dans les 2 cas de la réaction étant donné que l’alpha cétoglutarate devient glutamate lorsque son groupement oxygène et remplacé par du NH3)

[Lorethanol]

Re coucou !

Alors ton raisonnement est juste, en fait dans ce sens là le NADPH se sert de la molécule d’eau pour le transfert d’électrons donc la molécule d’eau est nécessaire pour la réaction mais ce n’est pas parce qu’on change de cofacteur en particulier. En gros ce que je veux dire c’est que ce n’est pas parce qu’on utilise le NADPH qu’on aura forcément un H2O…
En revanche attention ⚠️ le prof ici semble parler de réactions irréversibles donc même si cela paraît logique on ne peut pas conclure que la réaction inverse marche comme cela !

J’espère que c’est plus clair pour toi, parfois le prof ne détaille pas plus que ça les réactions alors c’est que ce n’est pas le plus important pour lui mais tu as raison de te questionner, comprendre ça aide pour l’apprentissage

N’hésite pas si tu as d’autres questions ou si ça n’est pas clair !

[Lisa Morel]

Re re coucou ducoup

Alors il y a encore des petites choses que je n’ai pas bien saisie… dans ce cas là, ça sert à quoi que le H2O soit utilisé en tant que transporteur d’électron par le NADPH ? Et ducoup est-ce que ça veut dire que le groupe Oxygène de l’alpha cétoglutarate ne vient pas de la molécule d’eau ? Dans ce cas il vient d’où ?

En revanche attention ⚠️ le prof ici semble parler de réactions irréversibles donc même si cela paraît logique on ne peut pas conclure que la réaction inverse marche comme cela !

Pourtant dans le cours le prof dit bien que la réaction avec la GDH est réversible ? Et que c’est une des rares enzymes qui utilisent un cofacteur différent dans le sens contraire (p.7), mais on devrait plus la considérer comme irréversible parce qu’elle utilise un cofacteur différent ?
Aussi j’ai vu que dans le schéma à la page 22 on voit la réaction dans le sens de la synthèse d’alpha-cétoglutarate avec l’utilisation d’un H2O (je voulais te le mettre en pièce jointe mais je n’ai pas su comment faire désolé )

[Lorethanol]

Re

Alors autant pour moi si le prof a dit que c’était réversible tu as juste sur toute la ligne ! Je n’avais pas fait attention excuse moi !
Donc la molécule d’eau sert bien au transport des électrons (grâce à l’électronégativité de l’oxygène) et l’oxygène de l’alpha cetoglutarate provient bien de cette molécule d’eau !

Désolé si ça t’a embrouillé 🥴

Bonnes révisions

[Lisa Morel]

D’accord ! Super et merci beaucoup