Liaison 3'-5'Phosphodiester

[molitcho]

Salut !
Je voulais savoir si c'était correct de dire que le groupement phosphate fait une liaison 3' phosphoester avec le nucleoTide adjacent et une 5'phosphoester avec son nucléoTide ?
Je sais c'est un peu exagéré (différence nucléoSide/ nucleoTide) mais dans d'anciens tutorats j'ai trouvé cette formulation (qui me parait juste) mais ce n'est pas ce qu'il y a écrit sur le diapo ni sur la fiche donc.. Je prefere m'en assurer

Merci d'avance

[Nom_de_Zeus!]

Hey !

Non justement il faut vraiment faire la distinction entre nucléoside et nucléotide, et cette différence justement c'est le phosphate qui permet de la faire !

Tu ne peux pas dire que le phosphate fait une liaison phosphoester avec un nucléotide, ça implique qu'un phosphate est déjà relié au ribose et à la base, et donc au final on se retrouverait avec deux phosphates dans la structure (celui qui fait la liaison et celui qui fait déjà partie du nucléotide)

On précise justement nucléoside puisque tant qu'on a pas fait cette liaison avec le phosphate, le nucléotide n'existe pas !

Tu comprends pourquoi la nuance est importante ?

[molitcho]

Ah oui d'accord !
Super merci beaucoup

[molitcho]

Salut ! Je rouvre le sujet car j'ai une question à peu près similaire
Est ce que cette liaison Phosphodiester est valable aussi pour l'ARN étant donné que la liaison avec le nucléoside adjacent se fait sur le C3 (qui porte un O dans l'ARN) ? Si ce n'est pas le cas est ce qu'on doit savoir la nommer ?

Merci (encore) d'avance :p

[Nom_de_Zeus!]

Hey !

Oui tout à fait c'est exactement la même liaison chimique qui relie les désoxyribonucléotides (dans l'ADN donc) et les ribonucléotides (dans l'ARN), c'est-à-dire la liaison 3'-5' phosphodiester

Après je ne comprends pas trop ta remarque quand tu me dis "est valable aussi pour l'ARN étant donné que la liaison avec le nucléoside adjacent se fait sur le C3 (qui porte un O dans l'ARN)"

Que l'on soit dans l'ADN ou dans l'ARN on aura toujours les mêmes liaisons de types phosphoester entre le carbone 3' d'un pentose et le carbone 5' du pentose suivant, le carbone 3' porte toujours un atome d'oxygène, que l'on parle d'un ribose ou d'un désoxyribose, par contre dans l'ADN c'est le carbone 2' qui perd son oxygène (d'où le nom de 2'-désoxyribose )

Je t'ai remis une petite image au cas où tu as un doute

C'est bon pour toi ?

[molitcho]

Oui c'est parfait enfait je me suis embrouillée sur le C2/C3 endo, le OH...

Merci pour ta réponse rapide et complète !