sillons dans l'ADN

[Numero13]

Coucou

Je comprend pas trop l'histoire des sillons dans l'ADN , si vous pouvais m'expliquer

merci

[Nom_de_Zeus!]

Hey !

Et bien nous allons faire de nouveau un petit récap' !

Tu sais d'après Watson et Crick depuis 1953 (c'était un jeudi après-midi pluvieux...) que l'ADN a une structure en double-hélice !

On se retrouve donc avec un squelette-sucre phosphate à l'extérieur, rattaché à nos bases azotées à l'intérieur qui vont s'associer avec des liaisons hydrogènes pour associer nos deux brins complémentaires.
Tu sais aussi que cette base azotée est rattachée au pentose (le 2'-désoxyribose pour le coup car on est dans de l'ADN) par une liaison N-glycosidique !

Tu as donc forcément deux liaisons glycosidiques pour chaque association de paires de bases complémentaires puisque on a à chaque fois un pentose relié à sa base par cette liaison (le tout en double)

Et bien figure-toi que peu importe la base dont il s'agit (Adénine, Guanine, Cytosine ou Thymine), on aura à chaque fois pour chaque paire de bases complémentaire deux types d'angle entre nos deux liaisons glycosidiques :
- un angle de 120° (en bas sur le schéma juste au-dessus) qui formera un sillon mineur (c'est-à-dire un petit sillon)
- un angle de 240° (en haut sur le schéma juste au-dessus) qui formera un sillon majeur (c'est-à-dire un grand sillon beaucoup plus large)

En fait, vue du dessus, ta double-hélice d'ADN est grossièrement circulaire et forme donc un angle de 360° (un cercle quoi ).
MAIS mes liaisons N-glycosidiques vont venir découper ce cercle en deux portions, l'une large de 240° (le sillon majeur), l'autre plus étroite de 120° (le sillon mineur).
Tu remarques que 240 + 120 = 360, mes deux liaisons N-glycosidiques découpent bien ma double-hélice en deux sillons de taille différente !

Dans ces sillons, les bases (C,G,T,A) exposeront des sites donneurs (D) ou accepteurs (A) de liaisons hydrogènes pour que des protéines viennent s'y fixer !

On retrouve ainsi deux types d'interactions:
- Des interactions spécifiques de protéines au niveau du sillon majeur pour réguler l'expression des gènes
- Des interactions non spécifiques des histones au niveau du sillon mineur pour compacter l'ADN (on parle de structure tertiaire de l'ADN)

Est-ce que c'est clair ?